RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-215ENST00000586268 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 OXER1Q8TDS5 423 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 TNFRSF25Q93038 417 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 USP28Q96RU2 1077 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 FEM1BQ9UK73 627 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.03■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 YEATS4O95619 227 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 NR5A1Q13285 461 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 BLIDQ8IZY5 108 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 SPATA32Q96LK8 384 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 C12orf42Q96LP6 360 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 FZD1Q9UP38 647 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD4L-215ENST00000586268 C19orf81C9J6K1 198 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 TRAK2O60296 914 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 GNA11P29992 359 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 BACE1P56817 501 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 MTMR2Q13614 643 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 DLK2Q6UY11 383 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 C6orf50Q9HD87 102 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PRR12Q9ULL5 1215 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 CSADQ9Y600 493 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 M0R2N6 131 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 MBD3O95983 291 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 UBE2HP62256 183 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 TRAF1Q13077 416 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 SPP2Q13103 211 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PRKG1Q13976 671 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 VGLL4Q14135 290 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 KLHL40Q2TBA0 621 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 ANO1Q5XXA6 986 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 LDHDQ86WU2 507 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 BICD2Q8TD16 824 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 RRAGCQ9HB90 399 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 SMCO2A6NFE2 343 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 TRAPPC10P48553 1259 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 COA7Q96BR5 231 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 AMNQ9BXJ7 453 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 POTEFA5A3E0 1075 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 UNCXA6NJT0 531 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 VCAM1P19320 739 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 ADCY7P51828 1080 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 STK38Q15208 465 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 FBXO11Q86XK2 927 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PCDHA6Q9UN73 950 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 CLIC4Q9Y696 253 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 TRIM75PA6NK02 468 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 GPT2Q8TD30 523 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 KIFC2Q96AC6 838 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PTPRFP10586 1907 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 PARP14Q460N5 1801 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD4L-215ENST00000586268 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms