RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 CEP95Q96GE4 821 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 MYH1P12882 1939 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 KRT31Q15323 416 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 MTMR7Q9Y216 660 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 FECHP22830 423 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 RBL2Q08999 1139 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 CNGA4Q8IV77 575 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 C6orf229H3BNL8 230 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 H7C1D1 291 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 MFAP3LO75121 409 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 CDC25AP30304 524 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 ELF2Q15723 593 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 SOGA3Q5TF21 947 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 COA1Q9GZY4 146 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 SMCO2A6NFE2 343 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 OR52Z1P0C646 297 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 ADSSL1Q8N142 457 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 TPM1P09493 284 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 PRCPP42785 496 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 TRIM14Q14142 442 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 RHOBTB3O94955 611 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 CCDC175P0C221 793 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 GABPAQ06546 454 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 N4BP3O15049 544 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 KLRC4O43908 158 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 NEK8Q86SG6 692 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 OGFRQ9NZT2 677 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.622e-6■■□□□ 12.2
SPNS1-207ENST00000565975 GDAQ9Y2T3 454 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 PP2D1A8MPX8 630 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 KCNJ18B7U540 433 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 FANCGO15287 622 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 CASQ1P31415 396 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 KCNJ12Q14500 433 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-207ENST00000565975 GYPCP04921 128 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 GTF2IP78347 998 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 STIM1Q13586 685 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CABP7Q86V35 215 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 PIGSQ96S52 555 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CPVLQ9H3G5 476 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 URI1O94763 535 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 PDHBP11177 359 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 GNG11P61952 73 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 USP17L5A8MUK1 530 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 SNHG28P0DPA3 235 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CASP14P31944 242 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 LETM2Q2VYF4 491 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 THAP9Q9H5L6 903 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 SWAP70Q9UH65 585 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 PPP1R2P41236 205 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 PSMA7O14818 248 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 PLCG1P19174 1290 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 MAP3K9P80192 1104 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CBX1P83916 185 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 MTF1Q14872 753 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 MNS1Q8NEH6 495 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-207ENST00000565975 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.11■■□□□ 1.61
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