RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	SV2C	Q496J9	727 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	BRF1	Q92994	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	INHBB	P09529	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NAT2	P11245	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ITGA4	P13612	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CD247	P20963	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	TNK2	Q07912	1038 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	KCNN1	Q92952	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	DNAJC7	Q99615	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	NCAN	O14594	1321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS2-208	ENST00000564123	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ESR1	P03372	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	KCNA10	Q16322	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	APBA2	Q99767	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	WHRN	Q9P202	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	AGRP	O00253	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PPM1B	O75688	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF445	P59923	1031 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123		H0Y8X5	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	EPN3	Q9H201	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	TBX1	O43435	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	KCNH1	O95259	989 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ITGAV	P06756	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBS2-208	ENST00000564123	BVES	Q8NE79	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms