RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM4AO75164 1064 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 CDC45O75419 566 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 RARBP10826 455 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 SNX17Q15036 470 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRC41Q15345 812 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 SLFN13Q68D06 897 aa23.58■■□□□ 1.37
RABGGTA-210ENST00000559586 POTEB2H3BUK9 544 aa23.57■■□□□ 1.36
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RABGGTA-210ENST00000559586 RNF180Q86T96 592 aa23.57■■□□□ 1.36
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RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.57■■□□□ 1.36
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RABGGTA-210ENST00000559586 TTC14Q96N46 770 aa23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM60Q495X7 471 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.54■■□□□ 1.36
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RABGGTA-210ENST00000559586 ANKS1AQ92625 1134 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 KRT23Q9C075 422 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 PHF24Q9UPV7 400 aa23.54■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 E7EWF7 191 aa23.53■■□□□ 1.36
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RABGGTA-210ENST00000559586 AKR1A1P14550 325 aa23.53■■□□□ 1.36
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RABGGTA-210ENST00000559586 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.53■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 DGKHQ86XP1 1220 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 FEM1BQ9UK73 627 aa23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC27A2O14975 620 aa23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC1A4P43007 532 aa23.51■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 KCTD1Q719H9 257 aa23.51■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 DDX11Q96FC9 970 aa23.51■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 ZBED4O75132 1171 aa23.5■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 TLE2Q04725 743 aa23.5■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 SHHQ15465 462 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 IQCA1Q86XH1 822 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF4Q8WV16 495 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 TNKSO95271 1327 aa23.5■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.5■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.49■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.49■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 LTBP2Q14767 1821 aa23.48■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 STAT2P52630 851 aa23.48■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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RABGGTA-210ENST00000559586 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 CASC1Q6TDU7 716 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXO40Q9UH90 709 aa23.48■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.47■■□□□ 1.35
RABGGTA-210ENST00000559586 FDX1P10109 184 aa23.47■■□□□ 1.35
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