RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549007.1

APAF1-208, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 3,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APAF1-208	ENST00000549007	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007		A0A1W2PP64	1363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	UBOX5	O94941	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	NTF4	P34130	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	SV2A	Q7L0J3	742 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	NINJ1	Q92982	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	BRF1	Q92994	677 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	MDFI	Q99750	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	HAUS7	Q99871	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ITGAV	P06756	1048 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	RNF180	Q86T96	592 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	PANK3	Q9H999	370 aa		4.9	□□□□□ -1.62
APAF1-208	ENST00000549007	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	WISP1	O95388	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NME9	Q86XW9	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FBLN1	P23142	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PDE6B	P35913	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	AOC2	O75106	756 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PDE4B	Q07343	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MYOM1	P52179	1685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PXDN	Q92626	1479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TM4SF5	O14894	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KPNA6	O60684	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NCAPH	Q15003	741 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	LILRB5	O75023	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	USP6	P35125	1406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PRODH	O43272	600 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	9e-6	■■□□□ 13.3
APAF1-208	ENST00000549007	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APAF1-208	ENST00000549007	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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