RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 ECE1P42892 770 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ADCY7P51828 1080 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 EVCP57679 992 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CCNA1P78396 465 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 TROAPQ12815 778 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 COG2Q14746 738 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MCTP2Q6DN12 878 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MOB2Q70IA6 237 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PIGSQ96S52 555 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CFAP45Q9UL16 551 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 FZD1Q9UP38 647 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 POTEIP0CG38 1075 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 POTEJP0CG39 1038 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 STK38Q15208 465 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CCL15Q16663 113 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 USH1GQ495M9 461 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 GALNT17Q6IS24 598 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 JMYQ8N9B5 988 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 EP400Q96L91 3159 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ALAS1P13196 640 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CDC27P30260 824 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 KRT85P78386 507 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 KRT40Q6A162 431 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 OXER1Q8TDS5 423 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 STK36Q9NRP7 1315 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SMCO2A6NFE2 343 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ZBTB5O15062 677 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SYT1P21579 422 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SREBF2Q12772 1141 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 FSTL1Q12841 308 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 RGMBQ6NW40 437 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 LTBP1Q14766 1721 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MAP3K10Q02779 954 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 DLK2Q6UY11 383 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 NSMFQ6X4W1 530 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 BRAPQ7Z569 592 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CLMNQ96JQ2 1002 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PHOX2BQ99453 314 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SCN9AQ15858 1988 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 POLR2MP0CAP2 368 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 COPB2P35606 906 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MB21D1Q8N884 522 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 WNK4Q96J92 1243 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CPVLQ9H3G5 476 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 MYH7P12883 1935 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 POTECB2RU33 542 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 BMP15O95972 392 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CFBP00751 764 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 VCAM1P19320 739 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 INHBEP58166 350 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRO-210ENST00000544244 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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