RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A0A1W2PQ27	194 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A0A1W2PQ64	194 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A0A1W2PQC6	194 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A0A1W2PQD8	194 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CTSK	P43235	329 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CDR1	P51861	262 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SYN1	P17600	705 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NR1I3	Q14994	352 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	JAML	Q86YT9	394 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM129C	Q86XR2	697 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	JMJD8	Q96S16	334 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GSTM1	P09488	218 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PFKL	P17858	780 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF76	P36508	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433		C9IYK1	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SHOX	O15266	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ACR	P10323	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CYBB	P04839	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CORO7	P57737	925 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CAP1	Q01518	475 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MVK	Q03426	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RNF34	Q969K3	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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