RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	CPXCR1	Q8N123	301 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	MYOG	P15173	224 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	RABGGTB	P53611	331 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	BEX3	Q00994	111 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CNTN2	Q02246	1040 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF536	O15090	1300 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	APBB1	O00213	710 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBED4	O75132	1171 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	IGFBP4	P22692	258 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	PLA2G5	P39877	138 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	RAB30	Q15771	203 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC174	Q6PII3	467 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	MSRA	Q9UJ68	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	RFXAP	O00287	272 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	RAD21	O60216	631 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	B4GALT4	O60513	344 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	RAB11FIP3	O75154	756 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	SMPD1	P17405	629 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	OAZ1	P54368	228 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CCL23	P55773	120 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	TFF2	Q03403	129 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	OSBP2	Q969R2	916 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	KIFC2	Q96AC6	838 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	SPC25	Q9HBM1	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	FEM1B	Q9UK73	627 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CABYR	O75952	493 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBM4B-208	ENST00000534198	EPOP	A6NHQ4	379 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	ERC2	O15083	957 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	TLL1	O43897	1013 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	PRDM1	O75626	825 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	KCNQ1	P51787	676 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	PSMC6	P62333	389 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	SCLY	Q96I15	445 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198		Q9Y3F1	56 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	BMP3	P12645	472 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBM4B-208	ENST00000534198	SLFN13	Q68D06	897 aa		10.38	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms