RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 ATG4CQ96DT6 458 aa23.62■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 PTPN18Q99952 460 aa23.62■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 PNMA2Q9UL42 364 aa23.62■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.62■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.61■■□□□ 1.37
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TSTA3-215ENST00000532308 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 MB21D1Q8N884 522 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.61■■□□□ 1.37
TSTA3-215ENST00000532308 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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TSTA3-215ENST00000532308 HERVK_113P62684 666 aa23.6■■□□□ 1.37
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TSTA3-215ENST00000532308 CCDC174Q6PII3 467 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSTA3-215ENST00000532308 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.58■■□□□ 1.37
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TSTA3-215ENST00000532308 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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TSTA3-215ENST00000532308 C8orf76Q96K31 380 aa23.56■■□□□ 1.36
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TSTA3-215ENST00000532308 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.54■■□□□ 1.36
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TSTA3-215ENST00000532308 BTBD7Q9P203 1132 aa23.53■■□□□ 1.36
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TSTA3-215ENST00000532308 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.52■■□□□ 1.36
TSTA3-215ENST00000532308 CNMDO75829 334 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 ALAS1P13196 640 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 SYT1P21579 422 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 CALML3P27482 149 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 COPB2P35606 906 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 KRT40Q6A162 431 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.51■■□□□ 1.35
TSTA3-215ENST00000532308 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.51■■□□□ 1.35
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