RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 INHBCP55103 352 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SURF1Q15526 300 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAQR3Q6TCH7 311 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZG16BQ96DA0 208 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KREMEN1Q96MU8 473 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MROH6A6NGR9 719 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF202O95125 648 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SYPP08247 313 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CELA3AP09093 270 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FOXE3Q13461 319 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MIIPQ5JXC2 388 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM26FQ5R3K3 315 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR42O15529 346 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASGR2P07307 311 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DBHP09172 617 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ITGB6P18564 788 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PBXIP1Q96AQ6 731 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EGFL7Q9UHF1 273 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ICMTO60725 284 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MCM7P33993 719 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNNI2P48788 182 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 YARSP54577 528 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGFL4Q6B9Z1 124 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM13CQ8NE31 585 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USP33Q8TEY7 942 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NOX5Q96PH1 765 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PATE3B3GLJ2 98 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRR5P85299 388 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARHGAP4P98171 946 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALG3Q92685 438 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF503Q96F45 646 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 JMJD8Q96S16 334 aa3.03□□□□□ -1.92
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.02□□□□□ -1.93
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLFN12Q8IYM2 578 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMC1Q8TDI8 760 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.02□□□□□ -1.93
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PQ64 194 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PQC6 194 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PQD8 194 aa3.01□□□□□ -1.93
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC142Q17RM4 750 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF207Q6ZRF8 634 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GLYCTKQ8IVS8 523 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PQJ5 194 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACRP10323 421 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 THBS2P35442 1172 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EPHB4P54760 987 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RPS26P62854 115 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM201Q5SNT2 666 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BICRALQ6AI39 1079 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SV2BQ7L1I2 683 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC74BQ96LY2 380 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDADC1Q9BWV3 514 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLCG1P19174 1290 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LMNB1P20700 586 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHMP4BP1P59074 171 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF4P78317 190 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MCTP2Q6DN12 878 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa2.99□□□□□ -1.93
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