RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509351.5

VNN3-211, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-211ENST00000509351 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 BIRC3Q13489 604 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ODF1Q14990 250 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ICE2Q659A1 982 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 DRC7Q8IY82 874 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 NXPE1Q8N323 547 aa6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 BLACEA4D250 179 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 J3QW42 95 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 MAP3K6O95382 1288 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 SETSIPP0DME0 302 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 RAG1P15918 1043 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 RHOQP17081 205 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 COPB2P35606 906 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 IL2P60568 153 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 MYBPC2Q14324 1141 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 CCDC89Q8N998 374 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 RNF217Q8TC41 542 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 SKA1Q96BD8 255 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 HAUS7Q99871 368 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.51□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 F5H423 210 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 EFSO43281 561 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 FKBP9O95302 570 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 AK2P54819 239 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 SIK1P57059 783 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PTPRN2Q92932 1015 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 FGD4Q96M96 766 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 SLC6A18Q96N87 628 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 MYD88Q99836 296 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 GLI2P10070 1586 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 CUL7Q14999 1698 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PRSS47A8MTI9 375 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 DLX3O60479 287 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 GTF2A2P52657 109 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 USP14P54578 494 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 NRLP54845 237 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 XP32Q5T750 250 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 TMEM192Q8IY95 271 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 POF1BQ8WVV4 589 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 FNIP2Q9P278 1114 aa6.5□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 B4E1Z4 1266 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 CBFA2T2O43439 604 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 FAM157BP0CG42 384 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 MCCP23508 829 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 GRIK1P39086 918 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 SLC19A1P41440 591 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 PDE4BQ07343 736 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 HDXQ7Z353 690 aa6.49□□□□□ -1.37
VNN3-211ENST00000509351 KIF18BQ86Y91 864 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms