RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 C6orf50Q9HD87 102 aa24.07■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.07■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 UBXN4Q92575 508 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 SNED1Q8TER0 1413 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 KCNJ18B7U540 433 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 KCNJ12Q14500 433 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 LETM2Q2VYF4 491 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 SOGA3Q5TF21 947 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.06■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 GYPCP04921 128 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 MYL1P05976 194 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 H7C1D1 291 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 CCDC51Q96ER9 411 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.05■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 GAKO14976 1311 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 ADSSL1Q8N142 457 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 CARD6Q9BX69 1037 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.04■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 SMARCA1P28370 1054 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 KCNB1Q14721 858 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 AK8Q96MA6 479 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 ZMYND15Q9H091 742 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 OR52Z1P0C646 297 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 GTF2IP78347 998 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 PIGSQ96S52 555 aa24.03■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 STIM1Q13586 685 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 NEK8Q86SG6 692 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 USP17L5A8MUK1 530 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 MAP3K9P80192 1104 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 CABP7Q86V35 215 aa24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CERKL-213ENST00000494398 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 PICALMQ13492 652 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TXNRD1Q16881 649 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 CUEDC2Q9H467 287 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 UBXN1Q04323 297 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 KIFC2Q96AC6 838 aa24.01■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 PSMA7O14818 248 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 KLRC4O43908 158 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TADA3O75528 432 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 RHOBTB3O94955 611 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 PLCG1P19174 1290 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 SEMA3FQ13275 785 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 RIMBP2O15034 1052 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 NOVP48745 357 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 DDR1Q08345 913 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TRIM14Q14142 442 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TMTC1Q8IUR5 882 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TBCKQ8TEA7 893 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TECP42680 631 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 PDHBP11177 359 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 LRRC15Q8TF66 581 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 AFF2P51816 1311 aa23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 F8W031 263 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 KIF5CO60282 957 aa23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TRIM47Q96LD4 638 aa23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 FECHP22830 423 aa23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 SP8Q8IXZ3 490 aa23.98■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 TMC4Q7Z404 712 aa23.97■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 THAP9Q9H5L6 903 aa23.97■■□□□ 1.43
CERKL-213ENST00000494398 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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