RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 TAF4O00268 1085 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MICAL2O94851 1124 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 IGBP1P78318 339 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ST5P78524 1137 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PRKCZQ05513 592 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NNTQ13423 1086 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RUNDC1Q96C34 613 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 A6NHS1 94 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 J3QL48 77 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ADCY3O60266 1144 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 USP17L7P0C7H9 530 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 COL6A1P12109 1028 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 HOXD10P28358 340 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 EPHB4P54760 987 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RING1Q06587 406 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SERINC3Q13530 473 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PWP1Q13610 501 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SCARF1Q14162 830 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 IER5Q5VY09 327 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PI16Q6UXB8 463 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 BADQ92934 168 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GPATCH3Q96I76 525 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NLRP3Q96P20 1036 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GABRQQ9UN88 632 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.04□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RELNP78509 3460 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PSMD14O00487 310 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ENPP3O14638 875 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MARCH6O60337 910 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GDF9O60383 454 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TLR2O60603 784 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RAB11FIP3O75154 756 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ALDH1B1P30837 517 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PTGIRP43119 386 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PRR20EP86478 221 aa5.03□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 PRR20DP86480 221 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PRR20BP86481 221 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PRR20AP86496 221 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 POLR3GLQ9BT43 218 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SPON2Q9BUD6 331 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PBX4Q9BYU1 374 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TMX1Q9H3N1 280 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 COPRSQ9NQ92 184 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.03□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 FLT4P35916 1363 aa5.03□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GAKO14976 1311 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 PHACTR2O75167 634 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 IL9P15248 144 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 GSTT1P30711 240 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 ANAPC15P60006 121 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 CBLBQ13191 982 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 KRT40Q6A162 431 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 Q6ZVU0 165 aa5.02□□□□□ -1.61
SHQ1-208ENST00000482785 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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