RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.85□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PSPNO60542 156 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CAPNS1P04632 268 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ATP2B1P20020 1258 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 MLECQ14165 292 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SLC14A2Q15849 920 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 TNNI3KQ59H18 835 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 CXorf38Q8TB03 319 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 RNF32Q9H0A6 362 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.84□□□□□ -1.63
TRBV1-201ENST00000476502 PEX10O60683 326 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CLEC3AO75596 197 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ESR1P03372 595 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 DLG4P78352 724 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 RASA3Q14644 834 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 SNX17Q15036 470 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 GAB4Q2WGN9 574 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CPLX3Q8WVH0 158 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 DRC1Q96MC2 740 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CRBNQ96SW2 442 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 KLHL25Q9H0H3 589 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 C19orf44Q9H6X5 657 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.83□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 OR14I1A6ND48 311 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 WASH4PA8MWX3 477 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ADRB1P08588 477 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 DDR2Q16832 855 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 DCAF15Q66K64 600 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 UBXN4Q92575 508 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 NBPF4Q96M43 638 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 HDAC8Q9BY41 377 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa4.82□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 GJB6O95452 261 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CELA3BP08861 270 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 RPL10P27635 214 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 GBP1P32455 592 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CTSKP43235 329 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 KCTD3Q9Y597 815 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 IRAK3Q9Y616 596 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.81□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 EPHX1P07099 455 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 KRTAP10-2P60368 255 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 RNF4P78317 190 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 NFKB2Q00653 900 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 PPP2R5EQ16537 467 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ADGRF1Q5T601 910 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 HAUS7Q99871 368 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 LNPKQ9C0E8 428 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 MCOLN1Q9GZU1 580 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 GP6Q9HCN6 339 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 PRR13Q9NZ81 148 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 APEX2Q9UBZ4 518 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.8□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CD247P20963 164 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF445P59923 1031 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 SLC7A5Q01650 507 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 CYP4F3Q08477 520 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 NR0B2Q15466 257 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 VHLLQ6RSH7 139 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 PIF1Q9H611 641 aa4.79□□□□□ -1.64
TRBV1-201ENST00000476502 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.9 ms