RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471676.1

HUWE1-208, Transcript of HECT, UBA and WWE domain containing 1, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene HUWE1, Length 501 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HUWE1-208	ENST00000471676	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	STXBP3	O00186	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	CD3E	P07766	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	IFNGR1	P15260	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	FUT4	P22083	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	POU4F1	Q01851	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	ZP2	Q05996	745 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	AURKA	O14965	403 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	FKTN	O75072	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	VAMP4	O75379	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	FAM153B	P0C7A2	387 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	GRIA2	P42262	883 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676		Q8N3U1	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HUWE1-208	ENST00000471676	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	WNT11	O96014	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SCG5	P05408	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	GSTM1	P09488	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	FGFR1	P11362	822 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	GFRA1	P56159	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	COPS5	Q92905	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	HOXC12	P31275	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SCRN1	Q12765	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HUWE1-208	ENST00000471676	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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