RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466635.1

SYP-203, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-203ENST00000466635 Q3C1V9 767 aa15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CCDC174Q6PII3 467 aa15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 REPS2Q8NFH8 660 aa15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 ERO1AQ96HE7 468 aa15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 NID2Q14112 1375 aa15.61■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 PFKFB2O60825 505 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 ICAM1P05362 532 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CDC27P30260 824 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 MAPK4P31152 587 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 SLC4A3P48751 1232 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 NBPF11Q86T75 865 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 MROH8Q9H579 483 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.6■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 ZBTB5O15062 677 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CYTH3O43739 400 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 PEX10O60683 326 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CDKL5O76039 1030 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 FCGRTP55899 365 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 QRICH1Q2TAL8 776 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 TKFCQ3LXA3 575 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 WDR78Q5VTH9 848 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 FBXO11Q86XK2 927 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 HOMER1Q86YM7 354 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 PIGSQ96S52 555 aa15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SYP-203ENST00000466635 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 ERCC3P19447 782 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 PSMC4P43686 418 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 LBX1P52954 281 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 ME3Q16798 604 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 PIBF1Q8WXW3 757 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 MTMR8Q96EF0 704 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 AMNQ9BXJ7 453 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 FBXO40Q9UH90 709 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 ZNF536O15090 1300 aa15.58■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 GNRH1P01148 92 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 ALAS1P13196 640 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 IFNAR1P17181 557 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 HOXD10P28358 340 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 SCRN1Q12765 414 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 CHST13Q8NET6 341 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 GTF3C6Q969F1 213 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 COA7Q96BR5 231 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 PORCNQ9H237 461 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 EFCC1Q9HA90 598 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 STRNO43815 780 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 FUT2Q10981 343 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 USH1GQ495M9 461 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 GPR142Q7Z601 462 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 NECAB1Q8N987 351 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 ACAD9Q9H845 621 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 RNF146Q9NTX7 359 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 ABCB11O95342 1321 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 LARGE1O95461 756 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 FCER1AP12319 257 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 KCTD2Q14681 263 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 NTRK3Q16288 839 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 PHKBQ93100 1093 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 TRIM47Q96LD4 638 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-203ENST00000466635 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms