RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CNMDO75829 334 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 IFNAR1P17181 557 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 SLC4A3P48751 1232 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CUL4AQ13619 759 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 C17orf99Q6UX52 265 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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SNHG12-201ENST00000461448 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 RLFQ13129 1914 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 REPS2Q8NFH8 660 aa22.64■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SNHG12-201ENST00000461448 PPFIA3O75145 1194 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 BCRP11274 1271 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ERVK-9P63128 1117 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ERVK-24P63145 666 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 FUT2Q10981 343 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 NTRK3Q16288 839 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 Q3C1V9 767 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PHKBQ93100 1093 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 TSKSQ9UJT2 592 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.64■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 STAT3P40763 770 aa22.63■■□□□ 1.21
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SNHG12-201ENST00000461448 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 MTMR8Q96EF0 704 aa22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PARP14Q460N5 1801 aa22.63■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB5O15062 677 aa22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 OAZ1P54368 228 aa22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 KIF3AQ9Y496 699 aa22.62■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.61■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 DTNBO60941 627 aa22.61■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ICAM1P05362 532 aa22.61■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 FBXO11Q86XK2 927 aa22.61■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF536O15090 1300 aa22.61■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 GPR25O00155 361 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ATP2A1O14983 1001 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 CCNA1P78396 465 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ST3GAL1Q11201 340 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 USH1GQ495M9 461 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 WASF1Q92558 559 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 CEP350Q5VT06 3117 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 STK36Q9NRP7 1315 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 ALAS1P13196 640 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 TRAF1Q13077 416 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PNMA2Q9UL42 364 aa22.6■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 CTDNEP1O95476 244 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SP3Q02447 781 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 WDR78Q5VTH9 848 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 AMNQ9BXJ7 453 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 RIPK3Q9Y572 518 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 DEXIO95424 95 aa22.58■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 SLC25A27O95847 323 aa22.58■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 PORCNQ9H237 461 aa22.58■■□□□ 1.21
SNHG12-201ENST00000461448 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 COA7Q96BR5 231 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 EFCC1Q9HA90 598 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 ERCC3P19447 782 aa22.57■■□□□ 1.2
SNHG12-201ENST00000461448 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.57■■□□□ 1.2
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