RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 KRT9P35527 623 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 LAD1O00515 517 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 FECHP22830 423 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 CDK8P49336 464 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 GPSM2P81274 684 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 LETM2Q2VYF4 491 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA1Q92805 767 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 UFL1O94874 794 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 STIM1Q13586 685 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TEX11Q8IYF3 940 aa23.03■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 KCNB1Q14721 858 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TERF2Q15554 542 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 TRIM47Q96LD4 638 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 CD209Q9NNX6 404 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-208ENST00000460766 KLRC4O43908 158 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SMCO2A6NFE2 343 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PSMA7O14818 248 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 MYL1P05976 194 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PRPHP41219 470 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 LRRC15Q8TF66 581 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 RABGGTAQ92696 567 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.01■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 RHOBTB3O94955 611 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 KIF20AO95235 890 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 ABL1P00519 1130 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CABP7Q86V35 215 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PARD6BQ9BYG5 372 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 BTAF1O14981 1849 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 OR52Z1P0C646 297 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PLCG1P19174 1290 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CHMP4BP1P59074 171 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 TXNRD1Q16881 649 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SLC35F6Q8N357 371 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 C6orf50Q9HD87 102 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 FLT1P17948 1338 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CTAGE9A4FU28 777 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PLA2G4AP47712 749 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 MB21D1Q8N884 522 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SNED1Q8TER0 1413 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 LGALS16A8MUM7 142 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 GNA11P29992 359 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SOGA3Q5TF21 947 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CERS3Q8IU89 383 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CEP95Q96GE4 821 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CDC23Q9UJX2 597 aa22.99■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 TOM1O60784 492 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 AK8Q96MA6 479 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CHP1Q99653 195 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 THAP9Q9H5L6 903 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 GGA1Q9UJY5 639 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 SBF2Q86WG5 1849 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 TTC26A0AVF1 554 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 TECP42680 631 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 NEK8Q86SG6 692 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PIGSQ96S52 555 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CUEDC2Q9H467 287 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PLCG2P16885 1265 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 CEP112Q8N8E3 955 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 ATP2B4P23634 1241 aa22.96■■□□□ 1.27
IMP4-208ENST00000460766 PDE4DQ08499 809 aa22.96■■□□□ 1.27
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