RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC174Q6PII3 467 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 STK36Q9NRP7 1315 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB5O15062 677 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 ZBED4O75132 1171 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A3P48751 1232 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 MTMR8Q96EF0 704 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 DEXIO95424 95 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 FDX1P10109 184 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXA4-202ENST00000428284 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 LBX2Q6XYB7 198 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 CPXCR1Q8N123 301 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 MB21D1Q8N884 522 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 SCG2P13521 617 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 GJB2P29033 226 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 WASF1Q92558 559 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 ALDH1A1P00352 501 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PLS1Q14651 629 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PKN1Q16512 942 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 USH1GQ495M9 461 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO11Q86XK2 927 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 REPS2Q8NFH8 660 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 AMNQ9BXJ7 453 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 ICAM1P05362 532 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 KIF3AQ9Y496 699 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF536O15090 1300 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PEX10O60683 326 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 OAZ1P54368 228 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.78■■□□□ 1.4
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HOXA4-202ENST00000428284 ALG1Q9BT22 464 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 WBP1LQ9NX94 342 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 BTBD7Q9P203 1132 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 CRHR2Q13324 411 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 FOSBP53539 338 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 COA7Q96BR5 231 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 PNMA2Q9UL42 364 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXA4-202ENST00000428284 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ATP2A1O14983 1001 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 CA12O43570 354 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 CNMDO75829 334 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 STAT3P40763 770 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TRAF1Q13077 416 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 BARHL2Q9NY43 387 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 TLR2O60603 784 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ALAS1P13196 640 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 XBP1P17861 261 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 NAPAP54920 295 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ERVK-9P63128 1117 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 ERVK-24P63145 666 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 CPA4Q9UI42 421 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 STXBP3O00186 592 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA4-202ENST00000428284 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.74■■□□□ 1.39
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