RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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SFTA3-201ENST00000418548 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 CCL15Q16663 113 aa16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.59■□□□□ 0.25
SFTA3-201ENST00000418548 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.59■□□□□ 0.25
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SFTA3-201ENST00000418548 INHBEP58166 350 aa16.58■□□□□ 0.24
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SFTA3-201ENST00000418548 HOMER1Q86YM7 354 aa16.58■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 C8orf76Q96K31 380 aa16.58■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 BARHL2Q9NY43 387 aa16.58■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
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SFTA3-201ENST00000418548 ZBED4O75132 1171 aa16.57■□□□□ 0.24
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SFTA3-201ENST00000418548 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.57■□□□□ 0.24
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SFTA3-201ENST00000418548 PTPN18Q99952 460 aa16.57■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 AMNQ9BXJ7 453 aa16.57■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PNMA2Q9UL42 364 aa16.57■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF536O15090 1300 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PITPNM1O00562 1244 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ATP2A1O14983 1001 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 OAZ1P54368 228 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 SNAP25P60880 206 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 NUCB2P80303 420 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 KRT40Q6A162 431 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 FBXO11Q86XK2 927 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 MB21D1Q8N884 522 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 MTMR6Q9Y217 621 aa16.56■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ESYT2A0FGR8 921 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PDHXO00330 501 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 BRD1O95696 1058 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ICAM1P05362 532 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 TM4SF4P48230 202 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 HERVK_113P62684 666 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 TRIM29Q14134 588 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 COA7Q96BR5 231 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PNMA3Q9UL41 463 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.55■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 H3BQV1 296 aa16.54■□□□□ 0.24
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SFTA3-201ENST00000418548 NOGQ13253 232 aa16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 PKP1Q13835 747 aa16.54■□□□□ 0.24
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SFTA3-201ENST00000418548 IFFO2Q5TF58 517 aa16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 GALNT17Q6IS24 598 aa16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC174Q6PII3 467 aa16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CALML3P27482 149 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 NAPAP54920 295 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 SREBF2Q12772 1141 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 POTEHQ6S545 545 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CAPNS2Q96L46 248 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 A0A0G2JMZ2 1700 aa16.53■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 ABCB11O95342 1321 aa16.52■□□□□ 0.24
SFTA3-201ENST00000418548 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
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