RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MC3RP41968 323 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FHL2Q14192 279 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DSC3Q14574 896 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAP3K11Q16584 847 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 AGMOQ6ZNB7 445 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LGI4Q8N135 537 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FBF1Q8TES7 1133 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KIF2CQ99661 725 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KLC2Q9H0B6 622 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RNF38Q9H0F5 515 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C12orf49Q9H741 205 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KLHL3Q9UH77 587 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 INVSQ9Y283 1065 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-1135P-201ENST00000411083 F8W031 263 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYBBP04839 570 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAPK8P45983 427 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRR5P85299 388 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM201Q5SNT2 666 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM124AQ86V42 546 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PALM2Q8IXS6 379 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 JMJD8Q96S16 334 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DEF6Q9H4E7 631 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ANTXR1Q9H6X2 564 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPG7Q9UQ90 795 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LTBP3Q9NS15 1303 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRAMEF1O95521 474 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DBHP09172 617 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 INHBEP58166 350 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RNF4P78317 190 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RGL3Q3MIN7 710 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BICRALQ6AI39 1079 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF585AQ6P3V2 769 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BORAQ6PGQ7 559 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 JAMLQ86YT9 394 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 AEBP1Q8IUX7 1158 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ALG3Q92685 438 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MINPP1Q9UNW1 487 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCSK5Q92824 1860 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MEIS1O00470 390 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TREHO43280 583 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ASGR2P07307 311 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LIG3P49916 1009 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ICAM4Q14773 271 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NBPF9Q3BBW0 867 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCDC82Q8N4S0 544 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NOX5Q96PH1 765 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DCTN4Q9UJW0 460 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MROH6A6NGR9 719 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SRGAP3O43295 1099 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SIGLEC6O43699 453 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DNAJA2O60884 412 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BPNT1O95861 308 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 USP48Q86UV5 1035 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TXNDC2Q86VQ3 553 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM52Q8NDY8 209 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHFRQ96EP1 664 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHST7Q9NS84 486 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 AP5S1Q9NUS5 200 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NAT16Q8N8M0 369 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDLIM7Q9NR12 457 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RGS13O14921 159 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF205O95201 554 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 VAV1P15498 845 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAPK1P28482 360 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PMLP29590 882 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BMP8BP34820 402 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATP2B2Q01814 1243 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SURF1Q15526 300 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms