RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 SLC6A18Q96N87 628 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PQY0 241 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 MPOP05164 745 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRC-204ENST00000367379 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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PTPRC-204ENST00000367379 SLC9A7Q96T83 725 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRC-204ENST00000367379 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.28□□□□□ -1.08
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PTPRC-204ENST00000367379 MSL3P1P0C860 447 aa8.18□□□□□ -1.1
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PTPRC-204ENST00000367379 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-204ENST00000367379 PWWP2AQ96N64 755 aa8.18□□□□□ -1.1
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