RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366170.6

VSTM1-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1-202ENST00000366170 PDHXO00330 501 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 CPXCR1Q8N123 301 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 ATG4CQ96DT6 458 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 AMNQ9BXJ7 453 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 PNMA3Q9UL41 463 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 PNMA2Q9UL42 364 aa14.97□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 MYPNQ86TC9 1320 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 VWA5AO00534 786 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 STX6O43752 255 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 NAPAP54920 295 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 NLRP5P59047 1200 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 NUCB2P80303 420 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 GUCY1B3Q02153 619 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 COA7Q96BR5 231 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 BARHL2Q9NY43 387 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.96□□□□□ -0.01
VSTM1-202ENST00000366170 RASSF10A6NK89 507 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 SREBF2Q12772 1141 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 USH1GQ495M9 461 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 KRT40Q6A162 431 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 CAPNS2Q96L46 248 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.95□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 SMCO2A6NFE2 343 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 STXBP3O00186 592 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 CALML3P27482 149 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 HERVK_113P62684 666 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 NOGQ13253 232 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 PLS1Q14651 629 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 MCTP1Q6DN14 999 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 MB21D1Q8N884 522 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 RGS22Q8NE09 1264 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 PTPN18Q99952 460 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 C6orf50Q9HD87 102 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.94□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ICAM1P05362 532 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 DDIT3P35638 169 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 STAT3P40763 770 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 TM4SF4P48230 202 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 OAZ1P54368 228 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ABCB11O95342 1321 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 CYP2C8P10632 490 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ALAS1P13196 640 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 GNA11P29992 359 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 GALNT17Q6IS24 598 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 LBX2Q6XYB7 198 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 IFNL1Q8IU54 200 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 MTMR6Q9Y217 621 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 RLFQ13129 1914 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF536O15090 1300 aa14.92□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 ATP2A1O14983 1001 aa14.91□□□□□ -0.02
VSTM1-202ENST00000366170 AOC2O75106 756 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms