RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 TRAPPC10P48553 1259 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF174Q15697 407 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 DLK2Q6UY11 383 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 PICK1Q9NRD5 415 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.49■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 WNT7AO00755 349 aa23.48■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 SCN4AP35499 1836 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 KLRG1Q96E93 195 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.47■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 A0A1B0GVL5 298 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 CUTAO60888 179 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 INF2Q27J81 1249 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 KIFC2Q96AC6 838 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 CLIC6Q96NY7 704 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 AMNQ9BXJ7 453 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.46■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 BMP15O95972 392 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 FBXO11Q86XK2 927 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 CUL5Q93034 780 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM260Q9NX78 707 aa23.45■■□□□ 1.35
TRIM4-202ENST00000354241 PTPRAP18433 802 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 MCM7P33993 719 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 MTMR2Q13614 643 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 FAM160B2Q86V87 743 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 FEM1BQ9UK73 627 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 CMA1P23946 247 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 SPP2Q13103 211 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 DGKZQ13574 1117 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 CAMK4Q16566 473 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 USH1GQ495M9 461 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 LPAR1Q92633 364 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.44■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 PTPREP23469 700 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 NDUFA8P51970 172 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 UBE2SQ16763 222 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 WDR18Q9BV38 432 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 PLA2G6O60733 806 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 SHC4Q6S5L8 630 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 TNMDQ9H2S6 317 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 KINO60870 393 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 USP14P54578 494 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 GRIN1Q05586 938 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 PTGDRQ13258 359 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 WDR90Q96KV7 1748 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 FSD2A1L4K1 749 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 PFKFB1P16118 471 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 RESP18Q5W5W9 173 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC174Q6PII3 467 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 OTOFQ9HC10 1997 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 TBCKQ8TEA7 893 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.41■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 BACE1P56817 501 aa23.4■■□□□ 1.34
TRIM4-202ENST00000354241 MAP3K11Q16584 847 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms