RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PGK1P00558 417 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FGAP02671 866 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SYCP3Q8IZU3 236 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PI4K2BQ8TCG2 481 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 MROH8Q9H579 483 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PIDD1Q9HB75 910 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SRRDQ9UH36 339 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-9P63128 1117 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-24P63145 666 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CEP95Q96GE4 821 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TNKSO95271 1327 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 STRNO43815 780 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLC10A3P09131 477 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FDX1P10109 184 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCL5P13501 91 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CHMLP26374 656 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 UBA7P41226 1012 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP1CQ5VVH2 108 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CHRDL2Q6WN34 429 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HINFPQ9BQA5 517 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DENND3A2RUS2 1198 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 KIF20AO95235 890 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB10O96000 172 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GJB1P08034 283 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ADORA2AP29274 412 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY7P51828 1080 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCL23P55773 120 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SPATC1LQ9H0A9 340 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CPVLQ9H3G5 476 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 NRBP2Q9NSY0 501 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 C4BP0C0L5 1744 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC169A6NNP5 214 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 GAS7O60861 476 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PLCD1P51178 756 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RCSD1Q6JBY9 416 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 DNAI2Q9GZS0 605 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1A1P14550 325 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLC51AQ86UW1 340 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G4DQ86XP0 818 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CDHR1Q96JP9 859 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA33Q96N06 139 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 YME1L1Q96TA2 773 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 WBP1LQ9NX94 342 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 SLURP2P0DP57 97 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 VCAM1P19320 739 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PDCP20941 246 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 CCND2P30279 289 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM199Q8N511 208 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 OSBP2Q969R2 916 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 ZIC5Q96T25 663 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-201ENST00000348564 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.04□□□□□ -1.6
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