RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS12P58397 1594 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 KRIT1O00522 736 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 RAB17Q9H0T7 212 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 PALD1Q9ULE6 856 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 ADCY9O60503 1353 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 TTC36A6NLP5 189 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 SAT1P21673 171 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRM-201ENST00000332175 NME8Q8N427 588 aa24.58■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PZPP20742 1482 aa24.58■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD18B2RXH4 712 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 RPN1P04843 607 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD1Q719H9 257 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 NUF2Q9BZD4 464 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PFKFB2O60825 505 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 NXNQ6DKJ4 435 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DPH5Q9H2P9 285 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 TXNDC9O14530 226 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0232Q92628 1395 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 INPP5BP32019 993 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM9Q13443 819 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DDAH1O94760 285 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 VCX3BQ9H321 246 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 FAM182BQ5T319 152 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2A3Q93084 1043 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PARP2Q9UGN5 583 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SSH3Q8TE77 659 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PGBD1Q96JS3 809 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SCYL1Q96KG9 808 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 KCNQ4P56696 695 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF445P59923 1031 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
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PTPRM-201ENST00000332175 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 GJA10Q969M2 543 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 HINFPQ9BQA5 517 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PTGDRQ13258 359 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CABS1Q96KC9 395 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DISC1Q9NRI5 854 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC2Q92887 1545 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 M0R2C6 588 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM37O94972 964 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 SIK1P57059 783 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 STX2P32856 288 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CROCCP2Q86T23 111 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 HESX1Q9UBX0 185 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFA8P51970 172 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC4O15439 1325 aa24.54■■□□□ 1.52
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PTPRM-201ENST00000332175 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 GDF11O95390 407 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 RPS6KA2Q15349 733 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 DPP9Q86TI2 863 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 BRD1O95696 1058 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 PROSER3Q2NL68 480 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 CSRNP1Q96S65 589 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRM-201ENST00000332175 STK38LQ9Y2H1 464 aa24.53■■□□□ 1.52
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