RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.54■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 STAMQ92783 540 aa21.54■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 TTC38Q5R3I4 469 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 CD302Q8IX05 232 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 ZIM3Q96PE6 472 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 INCENPQ9NQS7 918 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 HYOU1Q9Y4L1 999 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 FAM205CA6NFA0 338 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 FIGNQ5HY92 759 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 MTRQ99707 1265 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 KLC4Q9NSK0 619 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 EXOC1Q9NV70 894 aa21.53■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 A0A1W2PQJ5 194 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 PPP1R37O75864 691 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 CABP4P57796 275 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 METTL24Q5JXM2 366 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 MCM8Q9UJA3 840 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.52■■□□□ 1.04
NOP56-201ENST00000329276 RTL9Q8NET4 1388 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PAFAH1B1P43034 410 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TDO2P48775 406 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PTGDRQ13258 359 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCDC181Q5TID7 509 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 IFT20Q8IY31 132 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 IQCKQ8N0W5 287 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MREGQ8N565 214 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RASSF9O75901 435 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TRAPPC10P48553 1259 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 C8orf74Q6P047 294 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 SH2D4AQ9H788 454 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MEGF6O75095 1541 aa21.51■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CSF1RP07333 972 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 KCNB1Q14721 858 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PTGISQ16647 500 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CFAP58Q5T655 872 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 WLSQ5T9L3 541 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 C3orf20Q8ND61 904 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 GDAQ9Y2T3 454 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 FAM107AO95990 144 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ELF1P32519 619 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CDR1P51861 262 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ZNF174Q15697 407 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCDC96Q2M329 555 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCDC42Q96M95 316 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RNF14Q9UBS8 474 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.5■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PSMA7O14818 248 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MYL1P05976 194 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 NR1D1P20393 614 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PKN1Q16512 942 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TNFRSF25Q93038 417 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 SHISA4Q96DD7 197 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 GNAT2P19087 354 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 NF2P35240 595 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 ATP1A2P50993 1020 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.49■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 SLC7A5Q01650 507 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 PAK2Q13177 524 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 NLRP14Q86W24 1093 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 TRIM47Q96LD4 638 aa21.48■■□□□ 1.03
NOP56-201ENST00000329276 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms