RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 MAPK4P31152 587 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 SLC4A3P48751 1232 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 OAZ1P54368 228 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 PRKCZQ05513 592 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 FANCBQ8NB91 859 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.47■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 PLXNB2O15031 1838 aa23.46■■□□□ 1.35
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RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.46■■□□□ 1.35
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RAB11B-201ENST00000328024 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 SRRDQ9UH36 339 aa23.46■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RAB11B-201ENST00000328024 EVCP57679 992 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 WDR78Q5VTH9 848 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 ZBTB43O43298 467 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 SLC25A27O95847 323 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CALM1P0DP23 149 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CALM2P0DP24 149 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CALM3P0DP25 149 aa23.45■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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RAB11B-201ENST00000328024 PTPREP23469 700 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CDC27P30260 824 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 FLT3LGP49771 235 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 ARHGEF6Q15052 776 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 MORN1Q5T089 497 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 COA7Q96BR5 231 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 MROH8Q9H579 483 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 KIF5BP33176 963 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 USP6NLQ92738 828 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 AK2P54819 239 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 PIGSQ96S52 555 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 HOXD10P28358 340 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 NEK4P51957 841 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 GRB14Q14449 540 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 ALAS1P13196 640 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 FUT2Q10981 343 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 RTN1Q16799 776 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CENPFP49454 3210 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 RCAN1P53805 252 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 RNF146Q9NTX7 359 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 SMARCA1P28370 1054 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.341e-6■■□□□ 11.4
RAB11B-201ENST00000328024 HOMER1Q86YM7 354 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 NID2Q14112 1375 aa23.39■■□□□ 1.34
RAB11B-201ENST00000328024 ZBTB5O15062 677 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 STRNO43815 780 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 COBLO75128 1261 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 CYP2B6P20813 491 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 ADORA2AP29274 412 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 COPB2P35606 906 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 GNAQP50148 359 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 PRMT2P55345 433 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 BECN1Q14457 450 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 USH1GQ495M9 461 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 CHST13Q8NET6 341 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.39■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.38■■□□□ 1.33
RAB11B-201ENST00000328024 FCER1AP12319 257 aa23.38■■□□□ 1.33
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