RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.82□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.82□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 A0A1B0GVC2 190 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SFI1A8K8P3 1242 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 FYB1O15117 783 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MX2P20592 715 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RPS6KB1P23443 525 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 WEE1P30291 646 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 CHKAP35790 457 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 EVCP57679 992 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 DPYDQ12882 1025 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MTMR1Q13613 665 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SEMA3AQ14563 771 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 PPP2R5DQ14738 602 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SAMD9Q5K651 1589 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 PASD1Q8IV76 773 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 USP38Q8NB14 1042 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 CCDC114Q96M63 670 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MCF2LO15068 1137 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 KRT1P04264 644 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SKIP12755 728 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 PHKG2P15735 406 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MPP1Q00013 466 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TRIM14Q14142 442 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TM4SF20Q53R12 229 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 CEP135Q66GS9 1140 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 KDELC1Q6UW63 502 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 GBP6Q6ZN66 633 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MTMR8Q96EF0 704 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 EPSTI1Q96J88 318 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TNIP3Q96KP6 325 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 COG8Q96MW5 612 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 EYA1Q99502 592 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 DESI2Q9BSY9 194 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TTPALQ9BTX7 342 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RRN3Q9NYV6 651 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.81□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 NMT2O60551 498 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 P4HA1P13674 534 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MCM2P49736 904 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 USP11P51784 963 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 FAPQ12884 760 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 BOLA3Q53S33 107 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TEKT4Q8WW24 435 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 KCNN1Q92952 543 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 LRRC45Q96CN5 670 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 TNMDQ9H2S6 317 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 PTPRMP28827 1452 aa7.8□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ZNF254O75437 659 aa7.79□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 RFPL1O75677 317 aa7.79□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 SNX4O95219 450 aa7.79□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 MT-ND3P03897 115 aa7.79□□□□□ -1.16
RRN3-202ENST00000327307 ATP6V1AP38606 617 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms