RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 FANCBQ8NB91 859 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 CPVLQ9H3G5 476 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 BTBD7Q9P203 1132 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PLXNB2O15031 1838 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 GNAQP50148 359 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ERVK-9P63128 1117 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ERVK-24P63145 666 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 NBPF11Q86T75 865 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 CENPFP49454 3210 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PEX10O60683 326 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBED4O75132 1171 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PPP2R5BQ15173 497 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ATP2A1O14983 1001 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 CDC27P30260 824 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 OAZ1P54368 228 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF333Q96JL9 665 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 TRIM47Q96LD4 638 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 CYTH3O43739 400 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 ST18O60284 1047 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SMARCA1P28370 1054 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SRRDQ9UH36 339 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF536O15090 1300 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SNAP25P60880 206 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CCNA1P78396 465 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 Q3C1V9 767 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 MTMR8Q96EF0 704 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 LARGE1O95461 756 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CTGFP29279 349 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 PLS1Q14651 629 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC174Q6PII3 467 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 RAET1EQ8TD07 263 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 ICAM1P05362 532 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 COPB2P35606 906 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 STAT3P40763 770 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 STK3Q13188 491 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CPXCR1Q8N123 301 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 PORCNQ9H237 461 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBTB5O15062 677 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 PFKFB2O60825 505 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 ADD1P35611 737 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 FUT2Q10981 343 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 ME3Q16798 604 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 COA7Q96BR5 231 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 PIGSQ96S52 555 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 PNMA2Q9UL42 364 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 BRCA2P51587 3418 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC25A27O95847 323 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 MAPK4P31152 587 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 SCRN1Q12765 414 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 HOMER1Q86YM7 354 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-202ENST00000319107 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms