RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 RASGRF1Q13972 1273 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 MB21D1Q8N884 522 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 TTLL11Q8NHH1 800 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 LACRTQ9GZZ8 138 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 NFAT5O94916 1531 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 NTRK3Q16288 839 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 TCERG1LQ5VWI1 586 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 CPLX4Q7Z7G2 160 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 TBC1D7Q9P0N9 293 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 FAM184BQ9ULE4 1060 aa17.03■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 USP17L12C9JPN9 530 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 USP17L21D6R901 530 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 DNM2P50570 870 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 LPIN2Q92539 896 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 NMT2O60551 498 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 GUCY1A3Q02108 690 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 RAPGEF1Q13905 1077 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 HPS3Q969F9 1004 aa17.02■□□□□ 0.32
USP25-201ENST00000285679 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TRIM58Q8NG06 486 aa17.02■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.02■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 FTCDO95954 541 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CTSWP56202 376 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 KRT12Q99456 494 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 RAB21Q9UL25 225 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MYO1FO00160 1098 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MYBL2P10244 700 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 HDAC7Q8WUI4 952 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CALML4Q96GE6 196 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CABS1Q96KC9 395 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 DPYDQ12882 1025 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 HLFQ16534 295 aa17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ATP6V1AP38606 617 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TXKP42681 527 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 GYG1P46976 350 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SMIM22K7EJ46 135 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 EXOC5O00471 708 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 EHHADHQ08426 723 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CAVIN4Q5BKX8 364 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TMC4Q7Z404 712 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SGMS1Q86VZ5 419 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 IFT20Q8IY31 132 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MED15Q96RN5 788 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 GNAT2P19087 354 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 KIF5BP33176 963 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MCM9Q9NXL9 1143 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ASAP1Q9ULH1 1129 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MST1RQ04912 1400 aa17■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 GUCY2CP25092 1073 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 MS4A14Q96JA4 679 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 DCCP43146 1447 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 USP54Q70EL1 1684 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SEC24CP53992 1094 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NAPAP54920 295 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NAA25Q14CX7 972 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NBPF3Q9H094 633 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 BICDL2A1A5D9 508 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 GOLGA8HP0CJ92 632 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 NOX5Q96PH1 765 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 SPAG5Q96R06 1193 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 LTN1O94822 1766 aa16.99■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 TRAF5O00463 557 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 FOXP2O15409 715 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 APBA1Q02410 837 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
USP25-201ENST00000285679 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms