RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619938.1

DUXAP9-205, Transcript of double homeobox A pseudogene 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DUXAP9, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAP9-205ENST00000619938 SLC4A3P48751 1232 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 PDE4BQ07343 736 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 KLRC3Q07444 240 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 SNX17Q15036 470 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 ZNF792Q3KQV3 632 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 C1orf53Q5VUE5 145 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 SPC25Q9HBM1 224 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 PDLIM7Q9NR12 457 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 FBXO40Q9UH90 709 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 TACC3Q9Y6A5 838 aa13.1□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 SMIM22K7EJ46 135 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 NDUFB10O96000 172 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 CHGBP05060 677 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 TSPY3P0CV98 308 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 TSPY8P0CW00 308 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 TLE2Q04725 743 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 CPXCR1Q8N123 301 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 NUP133Q8WUM0 1156 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 KIFC2Q96AC6 838 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 DCTPP1Q9H773 170 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 FEM1BQ9UK73 627 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 FAM184BQ9ULE4 1060 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 TTC41PQ6P2S7 1318 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.09□□□□□ -0.31
DUXAP9-205ENST00000619938 DCDC2CA8MYV0 355 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 TTLL1O95922 423 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 PGK1P00558 417 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 CLTBP09497 229 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 FDX1P10109 184 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 RAG1P15918 1043 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 IKQ13123 557 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 C20orf194Q5TEA3 1177 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 REPS2Q8NFH8 660 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 BADQ92934 168 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 OSBP2Q969R2 916 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 FSD1Q9BTV5 496 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 NAPBQ9H115 298 aa13.08□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 A0A1W2PQY0 241 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 MOXD2PA6NHM9 499 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 ATP2A1O14983 1001 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 OAZ1P54368 228 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 SHHQ15465 462 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 CHST13Q8NET6 341 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 STARD7Q9NQZ5 370 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.07□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 POTEB2H3BUK9 544 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 PRDM1O75626 825 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 ACLYP53396 1101 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 FPGSQ05932 587 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 CCDC174Q6PII3 467 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 CEP95Q96GE4 821 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 GLT1D1Q96MS3 346 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 FAM161BQ96MY7 647 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 TMEM39AQ9NV64 488 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 MCM3APO60318 1980 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 PLIN4Q96Q06 1357 aa13.06□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 M0R2C6 588 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 KIAA0355O15063 1070 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 BMP3P12645 472 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 STAT2P52630 851 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 SLFN13Q68D06 897 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 FAM160B2Q86V87 743 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 IFNL3Q8IZI9 196 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 MKL1Q969V6 931 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
DUXAP9-205ENST00000619938 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms