RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM160B2Q86V87 743 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 HOMER1Q86YM7 354 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PIBF1Q8WXW3 757 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ14Q9UNX9 436 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 UNCXA6NJT0 531 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 BACE1P56817 501 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SYDE2Q5VT97 1194 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 WWC2Q6AWC2 1192 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMC9Q7Z3E5 817 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SPICE1Q8N0Z3 855 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP45Q9UL16 551 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 FZD1Q9UP38 647 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 STXBP3O00186 592 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT2P35908 639 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A2P36021 539 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 NLRP5P59047 1200 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKG1Q13976 671 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 FEM1BQ9UK73 627 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ZHX2Q9Y6X8 837 aa35.72■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM7Q96QT4 1865 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SPP2Q13103 211 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 IKQ13123 557 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 VGLL4Q14135 290 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM83BQ5T0W9 1011 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R18Q6NYC8 613 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 DLK2Q6UY11 383 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SHISA4Q96DD7 197 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf42Q96LP6 360 aa35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ESYT2A0FGR8 921 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEIP0CG38 1075 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEJP0CG39 1038 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 NOSTRINQ8IVI9 506 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM87AQ8NBN3 555 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 DAGLBQ8NCG7 672 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF28PB7ZC32 967 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF1Q13077 416 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR2Q13614 643 aa35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 BTBD18B2RXH4 712 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 MYSM1Q5VVJ2 828 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ZMYND12Q9H0C1 365 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa35.68■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 GNA11P29992 359 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 NAPAP54920 295 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA4Q9UN74 947 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 NCLP19338 710 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP1BP68106 108 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 NPY5RQ15761 445 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM173BQ6P4H8 233 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR12Q9ULL5 1215 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 CNPY2Q9Y2B0 182 aa35.67■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC285556D6RIA3 1793 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 PPATQ06203 517 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf50Q9HD87 102 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 EMILIN3Q9NT22 766 aa35.66■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 QRICH1Q2TAL8 776 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3D19Q5HYK7 790 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ERO1BQ86YB8 467 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 BLIDQ8IZY5 108 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 BICD2Q8TD16 824 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 NMRK2Q9NPI5 230 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 ELP1O95163 1332 aa35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 TYW1BQ6NUM6 668 aa35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 CHAMP1Q96JM3 812 aa35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 GLT8D2Q9H1C3 349 aa35.64■■■■□ 3.3
CAPNS1-206ENST00000588815 VCAM1P19320 739 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 RILPL1Q5EBL4 403 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 AMNQ9BXJ7 453 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 RLFQ13129 1914 aa35.63■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM75PA6NK02 468 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 LDLRAD1Q5T700 205 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX2Q8IWB9 1127 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 LMBRD1Q9NUN5 540 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR3EQ9NVU0 708 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 TMOD4Q9NZQ9 345 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE5A6NIY4 337 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 FDX1P10109 184 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 NR5A1Q13285 461 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 OXER1Q8TDS5 423 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF25Q93038 417 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-206ENST00000588815 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
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