RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L22D6RA61 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L19D6RCP7 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L20D6RJB6 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 KIF5BP33176 963 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 TM4SF4P48230 202 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 STAT2P52630 851 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 USP17L24Q0WX57 530 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 IFNL1Q8IU54 200 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 MTMR8Q96EF0 704 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 MYPNQ86TC9 1320 aa14.66□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 PDHXO00330 501 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 FLOT1O75955 427 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CYP2C8P10632 490 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SREBF2Q12772 1141 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 CUL4AQ13619 759 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 LBX2Q6XYB7 198 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 ATG4CQ96DT6 458 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 FEM1BQ9UK73 627 aa14.65□□□□□ -0.06
DNMT1-208ENST00000586667 JAK2O60674 1132 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CNMDO75829 334 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 IFNAR1P17181 557 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 DSG3P32926 999 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 HERVK_113P62684 666 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PPP2R5BQ15173 497 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 FAM160B2Q86V87 743 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SHISA4Q96DD7 197 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF536O15090 1300 aa14.64□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 MYH6P13533 1939 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 VWA5AO00534 786 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PEX10O60683 326 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PPFIA3O75145 1194 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SMARCA1P28370 1054 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 MAP2K2P36507 400 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 GNAQP50148 359 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SNAP25P60880 206 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PHKBQ93100 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 KIFC2Q96AC6 838 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 STK36Q9NRP7 1315 aa14.63□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 INHBEP58166 350 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 COG2Q14746 738 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PKN1Q16512 942 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 HSCBQ8IWL3 235 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PIGSQ96S52 555 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 BTBD7Q9P203 1132 aa14.62□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 PNMA3Q9UL41 463 aa14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.61□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ATP2A1O14983 1001 aa14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 ZBTB5O15062 677 aa14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
DNMT1-208ENST00000586667 CRHR2Q13324 411 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms