RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNNM3Q8NE01 707 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.39■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.39■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP49Q70CQ1 688 aa27.36■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CBFA2T2O43439 604 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BMP6P22004 513 aa27.35■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VSTM4Q8IW00 320 aa27.35■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP17L5A8MUK1 530 aa27.35■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.35■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERPINC1P01008 464 aa27.34■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STXBP3O00186 592 aa27.33■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPIP5K2O43314 1243 aa27.33■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INTS13Q9NVM9 706 aa27.33■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SERTAD1Q9UHV2 236 aa27.33■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BAG6P46379 1132 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ETF1P62495 437 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP100Q494V2 611 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAPPC10P48553 1259 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM65Q6PJ69 517 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FERMT2Q96AC1 680 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.31■■□□□ 1.96
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDHBP11177 359 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPSTI1Q96J88 318 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRIQ9BWK5 157 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCP110O43303 1012 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF20AO95235 890 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUPT20HQ8NEM7 779 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VWA3AA6NCI4 1184 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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