RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	PPP6R2	O75170	966 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	VGLL4	Q14135	290 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	CMA1	P23946	247 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	SHMT1	P34896	483 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TCF4-231	ENST00000566279	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	GABPA	Q06546	454 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	NR5A1	Q13285	461 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	DGKH	Q86XP1	1220 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	AP5Z1	O43299	807 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ADCY5	O95622	1261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	PFKFB1	P16118	471 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	RASA1	P20936	1047 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	LUZP1	Q86V48	1076 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CDK8	P49336	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	SHC4	Q6S5L8	630 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	EHD4	Q9H223	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	TBC1D12	O60347	775 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	XBP1	P17861	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CLCN1	P35523	988 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	GJA5	P36382	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	STX1A	Q16623	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CUTA	O60888	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	AOC2	O75106	756 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF202	O95125	648 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CAVIN2	O95810	425 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	AKR1B1	P15121	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CAP2	P40123	477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	FKBP1B	P68106	108 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	GRM4	Q14833	912 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	NPY5R	Q15761	445 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TCF4-231	ENST00000566279	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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