RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 ITGAVP06756 1048 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 RXRBP28702 533 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 PPP2R2AP63151 447 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 BVESQ8NE79 360 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 GP6Q9HCN6 339 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 FGFR1P11362 822 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 BMP3P12645 472 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 COL8A1P27658 744 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 CDH24Q86UP0 819 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 MFSD3Q96ES6 412 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 GOLGA3Q08378 1498 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 PLD2O14939 933 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 RFPL3O75679 317 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 MASP1P48740 699 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 PAOXQ6QHF9 649 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 NINJ1Q92982 152 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 EXOC2Q96KP1 924 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.21□□□□□ -1.09
TMOD3-208ENST00000560725 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CDK5R2Q13319 367 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 NIM1KQ8IY84 436 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 LGR6Q9HBX8 967 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 AKT3Q9Y243 479 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.21□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 GRB10Q13322 594 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 TM4SF20Q53R12 229 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 FAM209AQ5JX71 171 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 RIN3Q8TB24 985 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.2□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 EOMESO95936 686 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 CAPNS1P04632 268 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 L1CAMP32004 1257 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 KIR3DL1P43629 444 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF445P59923 1031 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 9.8
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TMOD3-208ENST00000560725 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 TSPOAP1O95153 1857 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PRXQ9BXM0 1461 aa8.19□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 KIAA0556O60303 1618 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 PRODHO43272 600 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 NFKBIBQ15653 356 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 NSMFQ6X4W1 530 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 BEND4Q6ZU67 534 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 FIBCD1Q8N539 461 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD3-208ENST00000560725 TBX1O43435 398 aa8.17□□□□□ -1.1
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