RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558734.1

SLTM-216, Transcript of SAFB like transcription modulator, human

TSL 5

Gene SLTM, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLTM-216	ENST00000558734	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CLEC3A	O75596	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ADRB1	P08588	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CCNF	P41002	786 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZNF165	P49910	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	RNF4	P78317	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	FKTN	O75072	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SYP	P08247	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	MEIS1	O00470	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SDHB	P21912	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	GLDC	P23378	1020 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ITGAE	P38570	1179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	MLEC	Q14165	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	KCNA10	Q16322	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	OXR1	Q8N573	874 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	NRDC	O43847	1150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZNF205	O95201	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	VAV1	P15498	845 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	VAMP1	P23763	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	NFIX	Q14938	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SNX17	Q15036	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	ZNF445	P59923	1031 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	DLG4	P78352	724 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CHRNE	Q04844	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	DUSP4	Q13115	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	PAK2	Q13177	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	RNF34	Q969K3	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLTM-216	ENST00000558734	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	PEX10	O60683	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	BMP8B	P34820	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	LINC00310	P59036	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLTM-216	ENST00000558734	KCNN1	Q92952	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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