RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	HMGCS2	P54868	508 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FAM160B2	Q86V87	743 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FEM1B	Q9UK73	627 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	VCAM1	P19320	739 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SYT1	P21579	422 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	DDIT3	P35638	169 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	STAT2	P52630	851 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	NUCB2	P80303	420 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	WNK4	Q96J92	1243 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PIGS	Q96S52	555 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172		H3BQV1	296 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CETP	P11597	493 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SCG2	P13521	617 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	XBP1	P17861	261 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	GJA5	P36382	358 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	GTF2A2	P52657	109 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	TRIM29	Q14134	588 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	COG2	Q14746	738 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PKN1	Q16512	942 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	MTMR8	Q96EF0	704 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ZBTB5	O15062	677 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	STX6	O43752	255 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FDX1	P10109	184 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	TRAF1	Q13077	416 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6	7e-6	■■□□□ 14.2
KLC1-223	ENST00000557172	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ZBED4	O75132	1171 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	FLOT1	O75955	427 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PNMA2	Q9UL42	364 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KLC1-223	ENST00000557172	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6

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