RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-208	ENST00000548896	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	MASTL	Q96GX5	879 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	POLI	Q9UNA4	740 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	ERCC3	P19447	782 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	PBX4	Q9BYU1	374 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	MUC3B	Q9H195	1237 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	ABL1	P00519	1130 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	ST5	P78524	1137 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	CAMTA2	O94983	1202 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	CES1	P23141	567 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HECTD4-208	ENST00000548896	SCN4A	P35499	1836 aa		10.4	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	CACNA1F	O60840	1977 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	RASSF10	A6NK89	507 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	FOXN1	O15353	648 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	DYRK3	O43781	588 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	NPR1	P16066	1061 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	NOS3	P29474	1203 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	CCDC93	Q567U6	631 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	PMEPA1	Q969W9	287 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	FZD9	O00144	591 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	FZD6	O60353	706 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	CDC27	P30260	824 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	ALDH1B1	P30837	517 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	TP53INP1	Q96A56	240 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	NPHP1	O15259	732 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	USP5	P45974	858 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	GPC2	Q8N158	579 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	EHHADH	Q08426	723 aa		10.36	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	CNTROB	Q8N137	903 aa		10.36	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		10.36	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.36	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		10.36	□□□□□ -0.75
HECTD4-208	ENST00000548896	ADAM19	Q9H013	955 aa		10.36	□□□□□ -0.75

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