RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CMTM1-220ENST00000534143 FOCADQ5VW36 1801 aa7.3□□□□□ -1.24
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CMTM1-220ENST00000534143 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.3□□□□□ -1.24
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CMTM1-220ENST00000534143 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 PALD1Q9ULE6 856 aa7.3□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 WDR90Q96KV7 1748 aa7.3□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.29□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 A0A1W2PNR3 127 aa7.29□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 F8W031 263 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 SLC27A2O14975 620 aa7.29□□□□□ -1.24
CMTM1-220ENST00000534143 BAG3O95817 575 aa7.29□□□□□ -1.24
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