RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532280.1

PTENP1-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 3,996 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-202ENST00000532280 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.11■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 STAT6P42226 847 aa16.11■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.11■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.11■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 DONSONQ9NYP3 566 aa16.11■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 GGT7Q9UJ14 662 aa16.11■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 KRT14P02533 472 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 WTAPQ15007 396 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 APOA5Q6Q788 366 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 RTN1Q16799 776 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 SOGA3Q5TF21 947 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.1■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 A0A1W2PQ27 194 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 A0A1W2PQ64 194 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 A0A1W2PQD8 194 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 TRIM65Q6PJ69 517 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 IFT20Q8IY31 132 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 MMS19Q96T76 1030 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 NFU1Q9UMS0 254 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 L1RE1Q9UN81 338 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 MAGEA1P43355 309 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 BCAMP50895 628 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 MXRA7P84157 204 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 CCDC63Q8NA47 563 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 CYP7A1P22680 504 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 GUCY1A2P33402 732 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 USP5P45974 858 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 POLE2P56282 527 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 ADCY1Q08828 1119 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 COG1Q8WTW3 980 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.09■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 NEDD4P46934 1319 aa16.08■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 NR1D1P20393 614 aa16.08■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 TUBB2AQ13885 445 aa16.08■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.08■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 PSD3Q9NYI0 1048 aa16.08■□□□□ 0.17
PTENP1-202ENST00000532280 PSMA7O14818 248 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 APBA1Q02410 837 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 PSMD2Q13200 908 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 DPH5Q9H2P9 285 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 CEP104O60308 925 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 ADAMTS2O95450 1211 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 KRT13P13646 458 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 LRP10Q7Z4F1 713 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 BTG4Q9NY30 223 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.08■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 SLC5A1P13866 664 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 ASIC1P78348 528 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 GRIN1Q05586 938 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 NAA35Q5VZE5 725 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 NELFBQ8WX92 580 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 LTN1O94822 1766 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 KCNQ4P56696 695 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 SLC39A14Q15043 492 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 PIGBQ92521 554 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 KRT12Q99456 494 aa16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTENP1-202ENST00000532280 SAAL1Q96ER3 474 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms