RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 CPVLQ9H3G5 476 aa21.91■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 CYTH3O43739 400 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 SLC16A2P36021 539 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.9■■□□□ 1.1
PUF60-217ENST00000531951 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.097e-6■■■□□ 16
PUF60-217ENST00000531951 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ADGRF4Q8IZF3 695 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PHKBQ93100 1093 aa21.89■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 STK36Q9NRP7 1315 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 FLOT1O75955 427 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.88■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 MYPNQ86TC9 1320 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 BTBD19C9JJ37 291 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 JAK2O60674 1132 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 MTMR8Q96EF0 704 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 CAPNS2Q96L46 248 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.87■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PPFIA3O75145 1194 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 INHBEP58166 350 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 NOGQ13253 232 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 GRM1Q13255 1194 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 COG2Q14746 738 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 KIFC2Q96AC6 838 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PTPN18Q99952 460 aa21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 DTNBO60941 627 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 DSG3P32926 999 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 C1QTNF8P60827 252 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SREBF2Q12772 1141 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PNMA3Q9UL41 463 aa21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PDHXO00330 501 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 OSBPP22059 807 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SLC4A3P48751 1232 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 HTRA3P83110 453 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PIGSQ96S52 555 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.84■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ZBTB5O15062 677 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 DEXIO95424 95 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 FDX1P10109 184 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 HSPA6P17066 643 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 LBX2Q6XYB7 198 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 HOMER1Q86YM7 354 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ATG4CQ96DT6 458 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 DDX11Q96FC9 970 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 ZIC5Q96T25 663 aa21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PUF60-217ENST00000531951 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PUF60-217ENST00000531951 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
PUF60-217ENST00000531951 VWA5AO00534 786 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms