RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 RAD50Q92878 1312 aa22.15■■□□□ 1.14
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TSTA3-211ENST00000529899 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-211ENST00000529899 GMCL1Q96IK5 515 aa22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-211ENST00000529899 FEM1BQ9UK73 627 aa22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-211ENST00000529899 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.15■■□□□ 1.14
TSTA3-211ENST00000529899 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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TSTA3-211ENST00000529899 ALPK3Q96L96 1907 aa22.13■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 MMP19Q99542 508 aa22.12■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 ZNF536O15090 1300 aa22.11■■□□□ 1.13
TSTA3-211ENST00000529899 SLC25A27O95847 323 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.11■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 ZBED4O75132 1171 aa22.1■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.1■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.09■■□□□ 1.13
TSTA3-211ENST00000529899 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.09■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 ATP2A1O14983 1001 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-211ENST00000529899 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-211ENST00000529899 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-211ENST00000529899 FAM160B2Q86V87 743 aa22.08■■□□□ 1.13
TSTA3-211ENST00000529899 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.08■■□□□ 1.13
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TSTA3-211ENST00000529899 CYBAP13498 195 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 KCTD2Q14681 263 aa22.07■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.07■■□□□ 1.12
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TSTA3-211ENST00000529899 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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TSTA3-211ENST00000529899 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 PLA2G6O60733 806 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 SNHG28P0DPA3 235 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 CNGA1P29973 690 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF543Q08ER8 600 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.05■■□□□ 1.12
TSTA3-211ENST00000529899 MAP4K1Q92918 833 aa22.05■■□□□ 1.12
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