RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 NBPF11Q86T75 865 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 COG2Q14746 738 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 MTMR8Q96EF0 704 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 FLOT1O75955 427 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 FDX1P10109 184 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC16A2P36021 539 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 C1QTNF8P60827 252 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 CAPNS2Q96L46 248 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 STK36Q9NRP7 1315 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 SREBF2Q12772 1141 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPN18Q99952 460 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 BTBD19C9JJ37 291 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 LBX2Q6XYB7 198 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 CPVLQ9H3G5 476 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-205ENST00000528462 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 HSPA6P17066 643 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 DSG3P32926 999 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 TM4SF4P48230 202 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PHKBQ93100 1093 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PNMA3Q9UL41 463 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 RLFQ13129 1914 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 KIFC2Q96AC6 838 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PARP14Q460N5 1801 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PDHXO00330 501 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 JAK2O60674 1132 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 OSBPP22059 807 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 VWA5AO00534 786 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB5O15062 677 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 DEXIO95424 95 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 MAP2K2P36507 400 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 MB21D1Q8N884 522 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PKN1Q16512 942 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 IFNL1Q8IU54 200 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 ATG4CQ96DT6 458 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGSQ96S52 555 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 ZIC5Q96T25 663 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP2A1O14983 1001 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 HERVK_113P62684 666 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 PNMA2Q9UL42 364 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF3AQ9Y496 699 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-205ENST00000528462 VEGFBP49765 207 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-205ENST00000528462 OAZ1P54368 228 aa25.45■■□□□ 1.66
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