RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD248Q9HCU0 757 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NTMQ9P121 344 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MTMR7Q9Y216 660 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF536O15090 1300 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP5-9P26371 169 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DPTQ07507 201 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PALM2Q8IXS6 379 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AMER2Q8N7J2 671 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C3orf58Q8NDZ4 430 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 INVSQ9Y283 1065 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PGRP06401 933 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRKCAP17252 672 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDK8P49336 464 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIAA2012Q0VF49 1180 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCNX4Q63HM2 1172 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USHBP1Q8N6Y0 703 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASPNQ9BXN1 380 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FOXP3Q9BZS1 431 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPIPB8E9PQR5 432 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GFRA2O00451 464 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NDUFB5O43674 189 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SSFA2P28290 1259 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SELENOPP49908 381 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ABHD18Q0P651 414 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BORAQ6PGQ7 559 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PI16Q6UXB8 463 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUP43Q8NFH3 380 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TCFL5Q9UL49 500 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MUSKO15146 869 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ABL1P00519 1130 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NCAM1P13591 858 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP10-11P60412 298 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF585AQ6P3V2 769 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TTLL7Q6ZT98 887 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLCO6A1Q86UG4 719 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM124AQ86V42 546 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DAGLBQ8NCG7 672 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LINC00116Q8NCU8 138 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNERQ8NFT8 737 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CITED4Q96RK1 184 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HDAC8Q9BY41 377 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DEF6Q9H4E7 631 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANO2Q9NQ90 1003 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1W2PQY0 241 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR182O15218 404 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FBXO24O75426 580 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GSTT1P30711 240 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IL12RB1P42701 662 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDE4BQ07343 736 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RGL3Q3MIN7 710 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BBS9Q3SYG4 887 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZPBP2Q6X784 338 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TCTN2Q96GX1 697 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NIF3L1Q9GZT8 377 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A087X1B8 175 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SRGAP3O43295 1099 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LAMTOR5O43504 91 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FKTNO75072 461 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CYBBP04839 570 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MC3RP41968 323 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms