RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506401.6

ITGA3-207, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 1,817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-207ENST00000506401 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 TMEM232C9JQI7 657 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 GALNT17Q6IS24 598 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 STXBP3O00186 592 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 USP17L10C9JJH3 530 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 ZBTB5O15062 677 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 NAPAP54920 295 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 PRKG1Q13976 671 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 OXER1Q8TDS5 423 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 MTMR8Q96EF0 704 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 WDR18Q9BV38 432 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 FZD1Q9UP38 647 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 ELP1O95163 1332 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 PTPRAP18433 802 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 STAT2P52630 851 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 NR5A1Q13285 461 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 USP28Q96RU2 1077 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-207ENST00000506401 USP14P54578 494 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 MAP3K9P80192 1104 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 DLK2Q6UY11 383 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 BLIDQ8IZY5 108 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 LPAR1Q92633 364 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 CDCA5Q96FF9 252 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 PLA2G6O60733 806 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 GNA11P29992 359 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 NPY5RQ15761 445 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 C6orf50Q9HD87 102 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 UBE2HP62256 183 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 FAM160B2Q86V87 743 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 FEM1BQ9UK73 627 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 SMCO2A6NFE2 343 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 MBD3O95983 291 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 SPP2Q13103 211 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 RRAGCQ9HB90 399 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 CSADQ9Y600 493 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 ESYT2A0FGR8 921 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 YEATS4O95619 227 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 BACE1P56817 501 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 ANO1Q5XXA6 986 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 BICD2Q8TD16 824 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 COA7Q96BR5 231 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 CLIC4Q9Y696 253 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 MTMR2Q13614 643 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 STK38Q15208 465 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 TNFRSF25Q93038 417 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 C19orf81C9J6K1 198 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 TRAF1Q13077 416 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 VGLL4Q14135 290 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 FBXO11Q86XK2 927 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 TRIM75PA6NK02 468 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-207ENST00000506401 ADCY7P51828 1080 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms