RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SCRIBQ14160 1630 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 H0Y8X5 98 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 NAT2P11245 290 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SPINK2P20155 84 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSKP43235 329 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PRKCQQ04759 706 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 MTERF2Q49AM1 385 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DTX1Q86Y01 620 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 TCTN2Q96GX1 697 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC15Q96MV8 337 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR13Q9NZ81 148 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PFDN2Q9UHV9 154 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 VAV3Q9UKW4 847 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 AKT3Q9Y243 479 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ESR1P03372 595 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PRNPP04156 253 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 GAB4Q2WGN9 574 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CREG2Q8IUH2 290 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 BVESQ8NE79 360 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ASB11Q8WXH4 323 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 MISP3Q96FF7 219 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC7Q99615 494 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DUSP13Q9UII6 198 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A087WZG4 1122 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 TBX1O43435 398 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 VAMP4O75379 141 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGAVP06756 1048 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CD8BP10966 210 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 LTKP29376 864 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 IKZF1Q13422 519 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRED2Q7Z698 418 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF227Q86WZ6 799 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 USHBP1Q8N6Y0 703 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 EPN3Q9H201 632 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 LRP2BPQ9P2M1 347 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC5A6Q9Y289 635 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 EMC9Q9Y3B6 208 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1W2PQU0 124 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 AGRPO00253 132 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS4O75173 837 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNH1O95259 989 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 GSNP06396 782 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SYPP08247 313 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 EGR3Q06889 387 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 STK11IPQ8N1F8 1099 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 LILRB2Q8N423 598 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 FLCNQ8NFG4 579 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 BTN2A2Q8WVV5 523 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 FKTNO75072 461 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 CD3EP07766 207 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP8BP34820 402 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP2R2AP63151 447 aa4.91□□□□□ -1.62
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