RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.66□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 DAGLBQ8NCG7 672 aa5.66□□□□□ -1.5
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SENP6-210ENST00000487548 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.66□□□□□ -1.5
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SENP6-210ENST00000487548 RAG1P15918 1043 aa5.65□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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SENP6-210ENST00000487548 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.65□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SENP6-210ENST00000487548 NUP43Q8NFH3 380 aa5.65□□□□□ -1.5
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SENP6-210ENST00000487548 RPTNQ6XPR3 784 aa5.62□□□□□ -1.51
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SENP6-210ENST00000487548 REC114Q7Z4M0 266 aa5.61□□□□□ -1.51
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SENP6-210ENST00000487548 SPATA25Q9BR10 227 aa5.61□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 CHST7Q9NS84 486 aa5.61□□□□□ -1.51
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SENP6-210ENST00000487548 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.61□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 K7ESM1 405 aa5.6□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 SIGLEC6O43699 453 aa5.6□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 CTSHP09668 335 aa5.6□□□□□ -1.51
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SENP6-210ENST00000487548 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.6□□□□□ -1.51
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SENP6-210ENST00000487548 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.6□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.59□□□□□ -1.51
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SENP6-210ENST00000487548 PFKLP17858 780 aa5.59□□□□□ -1.51
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SENP6-210ENST00000487548 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.59□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.59□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 JMJD8Q96S16 334 aa5.59□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 PALD1Q9ULE6 856 aa5.59□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.59□□□□□ -1.51
SENP6-210ENST00000487548 A0A1W2PQJ5 194 aa5.58□□□□□ -1.52
SENP6-210ENST00000487548 MSL3P1P0C860 447 aa5.58□□□□□ -1.52
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