RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485318.1

TRIM24-204, Transcript of tripartite motif containing 24, human

TSL 4

Gene TRIM24, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM24-204	ENST00000485318	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	RGS13	O14921	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	F13A1	P00488	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	PRKCA	P17252	672 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	PFKL	P17858	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	LMNB2	Q03252	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	MLEC	Q14165	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318		K7ESM1	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	FFAR3	O14843	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	SLURP1	P55000	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	CYP4F8	P98187	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	CAP1	Q01518	475 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318		A0A1W2PQY0	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	DNAJA2	O60884	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	PF4	P02776	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	RAG1	P15918	1043 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	RNF19A	Q9NV58	838 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRIM24-204	ENST00000485318		F6X3S4	739 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	UBOX5	O94941	541 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	LIMS1	P48059	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	NR1I3	Q14994	352 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318		A0A1W2PQ27	194 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318		A0A1W2PQ64	194 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318		A0A1W2PQC6	194 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318		A0A1W2PQD8	194 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	MPP2	Q14168	576 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	PSMD2	Q13200	908 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318		A0A1B0GTL3	188 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	MEIS1	O00470	390 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	CLEC3A	O75596	197 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	BMP8B	P34820	402 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	ZXDA	P98168	799 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRIM24-204	ENST00000485318	PWP1	Q13610	501 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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